在沸腾的薄膜和冷凝面之间的压差是蒸汽流向的驱动力，对于微小的压力降就会引起蒸汽的流动。在1mbar下运行要求在沸腾面和冷凝面之间很短的距离，刮膜式分子蒸馏装置中有一个内置冷凝器在加热面的对面。经转子上的料液分布器将其连续均匀地分布在加热面上，随即刮膜器将料液刮成一层薄、呈湍流状的液膜，并以螺旋状向下推进。在此过程中，从加热面上逸出的轻分子，经过短的路线和未经碰撞就到内置冷凝器上冷凝成液，并沿冷凝器管流下，通过位于蒸发器底部的出料管排出；残液即重分子在加热区下的圆形通道中收集，再通过侧面的出料管中流出。
       筒体要控制圆度与表面粗糙度，以适应刮板运动和成膜的需要，夹套的长度与分段则根据提供能源的途径、冷凝器结构以及刮板具体尺寸等参数来确认。当能源为导热油时，夹套内可以考虑设置导流板，以强化加热器的蒸发传热过程。筒体与上下封头组成密闭空腔。连接处要采用密封结构，以符合刮膜式分子蒸馏过程要求的很高真空度的严格要求，还要根据结构需要，在筒体上开设工艺仪表接口、冷却水进出口和蒸出液、蒸余液出口管等。为了让分子蒸馏器在很高真空度下工作的要求，通常选用双端面机械密封结构，在特定条件下甚至考虑磁流体密封结构，如果系统有要求时，也可以考虑磁力驱动设计，转轴处的动密封就转变为静密封，这将较好地保障很高真空度的要求。
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